Quando preciso digitalizar múltiplas páginas de documentos, o PDF final fica normalmente pesado. Esta linha de comando compacta o PDF original mantendo uma boa qualidade final.

gs -sDEVICE=pdfwrite -dPDFSETTINGS=/ebook -dCompatibilityLevel=1.4 -dNOPAUSE -dQUIET -dBATCH -sOutputFile=output.pdf input.pdf

O resultado final é para uso apenas digital ou para impressoras caseiras.

Caso precise compactar um PDF com links internos, acrescente: -dPrinted=false